Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rims1Q99NE5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rims1Q99NE5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rims1Q99NE5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms