Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Acss1Q99NB1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Acss1Q99NB1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms