Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrpl43Q99N89 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl43Q99N89 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl43Q99N89 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms