Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brms1Q99N20 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms