Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac9Q99N13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac9Q99N13 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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