Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Ms4a6dQ99N07 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ms4a6dQ99N07 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms