Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd1Q99MV1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Tdrd1Q99MV1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd1Q99MV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms