Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bbc3Q99ML1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Bbc3Q99ML1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms