Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprtQ99M80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtprtQ99M80 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtprtQ99M80 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
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