Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt84Q99M73 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt84Q99M73 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms