Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fars2Q99M01 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fars2Q99M01 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms