Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gins4Q99LZ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gins4Q99LZ3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms