Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp16Q99LG0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp16Q99LG0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms