Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RtcbQ99LF4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RtcbQ99LF4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RtcbQ99LF4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms