Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnf34Q99KR6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnf34Q99KR6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms