Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clint1Q99KN9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clint1Q99KN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms