Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rab28Q99KL7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab28Q99KL7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms