Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Reep3Q99KK1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Reep3Q99KK1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Reep3Q99KK1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms