Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms