Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b3Q921M3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms