Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc5a4bQ91ZP4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc5a4bQ91ZP4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms