Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pcdha8Q91Y12 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms