Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Creb3l3Q91XE9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Creb3l3Q91XE9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms