Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usb1Q91W78 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usb1Q91W78 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usb1Q91W78 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms