Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NifkQ91VE6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NifkQ91VE6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms