Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SelenomQ8VHC3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SelenomQ8VHC3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms