Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE37

Rcc1, Regulator of chromosome condensation, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcc1Q8VE37 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcc1Q8VE37 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rcc1Q8VE37 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rcc1Q8VE37 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms