Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8VDP2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8VDP2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms