Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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