Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Sft2d2Q8VD57 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sft2d2Q8VD57 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sft2d2Q8VD57 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sft2d2Q8VD57 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sft2d2Q8VD57 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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