Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VCE4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8VCE4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms