Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc12Q8R344 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc12Q8R344 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms