Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc12Q8K5B8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms