Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q6

Neil1, Endonuclease 8-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil1Q8K4Q6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Neil1Q8K4Q6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil1Q8K4Q6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil1Q8K4Q6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil1Q8K4Q6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil1Q8K4Q6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Neil1Q8K4Q6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms