Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rdh16f2Q8K3M1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rdh16f2Q8K3M1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rdh16f2Q8K3M1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rdh16f2Q8K3M1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rdh16f2Q8K3M1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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