Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MyripQ8K3I4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MyripQ8K3I4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms