Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stn1Q8K2X3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stn1Q8K2X3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stn1Q8K2X3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms