Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fbxo18Q8K2I9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fbxo18Q8K2I9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo18Q8K2I9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms