Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mtmr3Q8K296 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms