Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms