Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek9Q8K1R7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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