Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm17Q8JZX4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm17Q8JZX4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm17Q8JZX4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm17Q8JZX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm17Q8JZX4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm17Q8JZX4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbm17Q8JZX4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm17Q8JZX4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms