Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms