Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf628Q8CJ78 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Znf628Q8CJ78 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Znf628Q8CJ78 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Znf628Q8CJ78 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf628Q8CJ78 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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