Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LgsnQ8CIX8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LgsnQ8CIX8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms