Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz3Q8CGV9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz3Q8CGV9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms