Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl1Q8CEQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms