Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Usp27Q8CEG8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp27Q8CEG8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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