Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc178Q8CDV0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc178Q8CDV0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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