Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

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Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E4f1Q8CCE9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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E4f1Q8CCE9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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E4f1Q8CCE9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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E4f1Q8CCE9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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E4f1Q8CCE9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E4f1Q8CCE9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E4f1Q8CCE9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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